Antecedentes
Los primeros pasos para evaluar la calidad del agua en nuestro país los realizó el Dr. Clodomiro Picado en 1911, utilizando las aguas superficiales del Río Tiribí, a la altura de Tres  Ríos  y  San José.  Luego, en  el  Gobierno  del Dr. Rafael Ángel Calderón Guardia, se dictó el Decreto Ejecutivo N° 9 el cual expresa literalmente:
 
“Artículo 1.     Créase un Laboratorio para el control de aguas potables, dependiente del Instituto Nacional de Higiene”.
 
  “Artículo 2.   Dicho Laboratorio tendrá carácter oficial y jurisdicción en toda la República.  Su asiento permanente estará en la Planta Purificadora ubicada en el centro de La Unión”.
 
Hasta 1962 este Decreto fue “letra muerta”.  Fue con la creación del Servicio Nacional de Acueductos y Alcantarillados que inició funciones el Laboratorio Central de AyA.  El personal del mismo realizó los primeros exámenes de agua en Tres Ríos, el 20 de enero de 1964.  Para ello se acondicionó un corredor en la antigua casa del ingeniero jefe de la Planta de Tratamiento.  Según informes del Dr. Edgar Ortiz, “gestor y padre de la criatura”, el 1° de agosto del mismo año comenzaron los trabajos de remodelación y acondicionamiento de dicha casa.  El número de funcionario era de 9 personas: 2 Microbiólogos,  1 Químico,  2 Asistentes  de  Laboratorio III, 2 Asistentes II para la recolección de muestras, 1 Auxiliar y 1 Secretaria.  El ámbito de acción del control de calidad era solamente para AyA y el Área Metropolitana.  En 1970 este control se amplió a los otros acueductos urbanos administrados y operados por AyA.  En la década de los 80 el rumbo del laboratorio cambió, al iniciarse varias investigaciones en el campo de la contaminación ambiental, como por ejemplo:
 
·         Estudio de la Calidad de las Aguas de Playas de Limón y Puntarenas.
 
·         Criterios Microbiológicos y Calidad Sanitaria de las Playas de Costa Rica 1986-1987.
 
·         Evaluación de la Contaminación Orgánica de la Cuenca 24 (Río Grande de Tárcoles 1981-1985).
 
·         Evaluación de la Contaminación Fecal del Río Barranca.
 
En la década de los 90 se crea por primera vez una “División de Calidad del Agua”, con el objetivo de brindarle más impulso a la vigilancia y la calidad de la misma, y se construye e inicia labores en el Laboratorio Regional de Puntarenas.  Además, el laboratorio incursionó con más vigencia en el ámbito higiénico-sanitario del país, al divulgar las siguientes investigaciones:
 
·           Calidad Sanitaria de los Refrescos Naturales en Costa Rica.
 
·           Calidad Bacteriológica del Hielo en Costa Rica.
 
·           Calidad Sanitaria de las Aguas de Piscina en Costa Rica.
 
·           Contaminación Bacteriana de los Cepillos de Dientes.
 
·           Diagnóstico Sanitario de las Playas de Limón 1980-1989.
 
Las anteriores investigaciones, aunadas al esfuerzo realizado en el Programa Nacional de Prevención del Cólera, hicieron que nuestro laboratorio ampliara su prestigio a nivel nacional e internacional.  En la Gaceta N°109 del 09/06/1997 se designa al Laboratorio Central de AyA como Laboratorio Nacional de Aguas (LNA),  ampliándose el rango de acción a todo el país y a todos los entes operadores de acueductos.  El mismo dicta:
 
“Artículo 1° --- Designar al Laboratorio Central del Instituto Costarricense de Acueductos y Alcantarillados, como el Laboratorio Nacional de Aguas, para la realización de estudios técnicos y análisis necesarios requeridos por el Ministerio de Salud, y para que le brinden a este Ministerio la asesoría técnica que requiera, conforme con las disposiciones contenidas en el artículo 353 de la Ley General de Salud.  El costo de los servicios y análisis, ya sea para control o vigilancia de la calidad del agua, serán cubiertos por el interesado.”
 
“Artículo 2° --- De acuerdo con su área de especialización, el Laboratorio Nacional de Aguas, constituirá el centro de referencia nacional para las determinaciones físico químicas y biológicas de las aguas.  El Laboratorio contará con un sistema de aseguramiento de la calidad analítica debidamente acreditado.”
 
“Artículo 3° --- El Ministerio de Salud, por medio de la División de Saneamiento, junto con el Laboratorio Nacional de Aguas, coordinarán el Programa Nacional de Control y Vigilancia de la Calidad del Agua, de acuerdo con las necesidades cuantitativas y cualitativas de ambas instituciones.”
 
El 18 de enero del 2008 el LNA se “ACREDITA” ante el Ente Costarricense de Acreditación (ECA), mediante la Norma INTE-ISO/IEC 17025:2005, convirtiéndose en el primer laboratorio de aguas acreditado a nivel Latinoamericano, como queda en manifiesto con el certificado que identifica al LNA como laboratorio acreditado y que se presenta a continuación. 
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En el “ALCANCE” de la ACREDITACIÓN se incluyeron inicialmente 52 técnicas de análisis de laboratorio (Para agua de consumo y aguas residuales), 2 técnicas de muestreo y la gestión.  En el  año 2010 se logra su ampliación  al acreditar 3 técnicas de laboratorio adicionales, al igual que sucede en el 2011, para contar en la actualidad con 58 técnicas de laboratorio, el muestreo y la gestión debidamente acreditadas.  Durante los últimos años se ha trabajado para lograr ampliar el “ALCANCE” y acreditar las inspecciones sanitarias a través de la Norma INTE-ISO/IEC 17020-2012.
 
 
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